De hecho, la pregunta se reduce a "¿se puede crear un sitio wordpress a medida"?
En términos absolutos, la respuesta es sí, siempre y cuando el webmaster sepa codificar, trabajar con CSS y adaptar el tema del sitio Wordpress y sus módulos.
Pero en general, si eliges Wordpress desde el principio, no es necesariamente para ir a la ultra-personalización, sino al contrario para aprovechar la ergonomía que está bastante cerca de un tema atractivo y/o visualmente cerca de la versión ideal que tienes en mente.
A la hora de adaptar la carta gráfica y la identidad visual, eso no es realmente un problema.
La verdadera cuestión fundamental será la capacidad de interactuar con sistemas de gestión de terceros.
Los sitios de comercio electrónico son a menudo el "receptáculo" de los clientes potenciales y los clientes entrantes, pero estos mismos sitios pueden interconectarse con una serie de sistemas periféricos (CRM, ERP, software de ventas, software de gestión de existencias, etc.).
Es quizás en base a estos criterios que deberías juzgar si Wordpress / WooCommerce son los más apropiados para estos temas de integración, o si deberías optar por sistemas de E-Commerce dedicados (como Prestashop / Magento).
ES